Các nguyên nhân dẫn đến sự suy giảm đa dạng sinh học bao gồm:
1. Mất môi trường sống tự nhiên: Do quá trình khai thác và sử dụng không bền vững các tài nguyên tự nhiên như rừng, đất, nước, đá, khoáng sản, việc đô thị hóa, công nghiệp hóa, đánh bắt thủy sản và đặc biệt là sự biến đổi khí hậu, làm mất mát môi trường sống của nhiều loài động thực vật.
2. Sự tiêu thụ quá mức các tài nguyên tự nhiên: Con người đang tiêu thụ một lượng tài nguyên thiên nhiên nhanh chóng vượt quá tốc độ tái tạo.
3. Sự đe dọa từ việc xâm nhập lên các loài động vật và thảnh thơi các loài thực vật lạ và gây ra những thay đổi trong hệ thống sinh thái.
4. Sự đe dọa từ các hoạt động của con người như đốt rừng, sử dụng các loại thuốc trừ sâu, đánh bắt trái phép và buôn bán các loài động vật quý hiếm.
5. Sự tàn phá của các loài động vật quý hiếm vì các mục đích thương mại như đánh bắt, săn bắt một phần đổ lỗi vào niềm đam mê săn bắt và trưng bày các loài vật quý hiếm trong các sân vận động.
6. Sự thay đổi môi trường sinh sống làm thay đổi cả cấu trúc và chức năng của các thành phần động vật và thực vật của hệ sinh thái.
7. Sự đe dọa từ các loài dịch nhưng thường xuyên xảy ra cũng là một yếu tố gây suy giảm đa dạng sinh học.
8. Các cơ sở hạ tầng phát triển nhanh chóng gây ra sự xâm chiếm vào các cụm cây bụi nước của rừng để trở thành đô thị mới, mà không những không đưa ra giải pháp bảo tồn các loài động vật và thực vật mà còn gây ra những phá hủy.
Những nguyên nhân này đều gây ra sự suy giảm đa dạng sinh học, làm mất đi các thành phần quý giá và không thể khôi phục lại được trong tương lai.