Có nhiều nguyên nhân gây suy giảm tài nguyên biển-đảo, bao gồm:

1. Khai thác quá mức: Những hoạt động khai thác quá mức như đánh bắt quá đà, đánh bại cây san hô, đào dưới đáy biển hoặc đào tạo đảo giảm thiểu các loài sinh vật cần thiết để duy trì và phát triển một hệ sinh thái lành mạnh.

2. Ô nhiễm: Sự suy giảm tài nguyên biển còn được gây ra bởi sự xuất hiện của nhiều chất độc hại, như dầu, hóa chất, chất thải sinh hoạt và công nghiệp. Các loài sinh vật biển cũng bị ảnh hưởng nghiêm trọng bởi sự ô nhiễm này.

3. Biến đổi khí hậu: Biến đổi khí hậu làm cho nhiệt độ biển tăng lên, làm cho nhiều sinh vật biển chịu áp lực, các sinh vật khác phải di chuyển đi tìm nước lạnh hơn. Biến đổi khí hậu còn có thể gây ra gia tăng mực nước biển, làm mất đi rất nhiều đảo nhỏ và ảnh hưởng đến các động vật sống trong nước.

Một phương hướng bảo vệ tài nguyên biển-đảo quan trọng nhất là việc tăng cường thông tin và giáo dục cho những người sống gần biển, cảnh báo những hệ quả tiềm tàng của lạm dụng tài nguyên và ủng hộ sự bảo vệ sức khỏe của hệ sinh thái biển đảo. Việc giám sát tình hình tài nguyên biển đảo để đưa ra các chính sách quản lý hiệu quả hơn cũng rất quan trọng.