Các hiện tượng tự nhiên như sạt lở đất đồi núi, bờ sông cuốn vào dòng nước bùn, đất, mùn... Chúng sẽ làm giảm chất lượng của nước. Khói bụi từ sự phun trào núi lửa theo nước mưa rơi xuống cũng làm ô nhiễm không khí, đất, nước tại các khu vực lân cận. Địa chất chứa quá nhiều khoáng, hợp chất như kim loại, Flo, Asen... cũng khiến môi trường xung quanh nhiễm độc theo.

Ngoài ra, sự phân hủy xác các động thực vật, thành chất hữu cơ cũng gây ô nhiễm không khí, ô nhiễm nước mặt, mạch nước ngầm. Đặc biệt, với một hệ thống nối liền phức tạp của các dòng chảy ao hồ, kênh rạch như ở Việt Nam thì một khu vực ô nhiễm có thể lan rất nhanh tới cả hệ thống.

Các thiên tai, thảm họa thiên nhiên xảy ra như lũ lụt, mưa bão... Cũng là nguyên nhân khiến chất lượng môi trường sống giảm sút nhanh chóng và khó khống chế.

Tất cả các hoạt động sản xuất sinh hoạt hằng ngày của con người đều sinh ra những chất thải nguy hại cho môi trường.
 

• Chất thải sinh hoạt của cá nhân đến các cơ quan, khách sạn, nhà hàng, bệnh viện...
• Chất thải nông nghiệp từ phân, nước tiểu gia súc, phân bón, hóa chất...
• Chất thải công nghiệp nguy hiểm làm ô nhiễm môi trường nghiêm trọng
• Do các chất thải từ phương tiện giao thông
• Do sử dụng các nguyên liệu hóa thạch để đun nấu
• Ô nhiễm môi trường do phóng xạ bởi các vụ nổ hạt nhân, chiến tranh và các quá trình tự nhiên như phân rã phóng xạ của radon.