Để tính quãng đường ôtô đã đi trong cả giai đoạn, chúng ta có thể chia ra làm hai phần:

1. **Phần 1: Đi trên đường bằng phẳng**
- Vận tốc \( v_1 = 60 \) km/h
- Thời gian \( t_1 = 10 \) phút = \( \frac{10}{60} \) giờ = \( \frac{1}{6} \) giờ
- Quãng đường \( d_1 = v_1 \times t_1 = 60 \) km/h \( \times \frac{1}{6} \) h = \( 10 \) km

2. **Phần 2: Lên dốc**
- Vận tốc \( v_2 = 40 \) km/h
- Thời gian \( t_2 = 3 \) phút = \( \frac{3}{60} \) giờ = \( \frac{1}{20} \) giờ
- Quãng đường \( d_2 = v_2 \times t_2 = 40 \) km/h \( \times \frac{1}{20} \) h = \( 2 \) km

**Tổng quãng đường ôtô đã đi**:
\[
d = d_1 + d_2 = 10 \text{ km} + 2 \text{ km} = 12 \text{ km}
\]

Vậy, quãng đường ôtô đã đi trong cả giai đoạn là **12 km**.

**Đáp án:** A. 12 km.