Phép lai phân tích là phép lai giữa cá thể mang tính trạng trội cần xác định kiểu gen với cá thể mang tính trạng lặn. Nếu kết quả của phép lai là đồng tính thì cá thể mang tính trạng trội có kiểu gen đồng hợp, còn kết quả phép lai là phân tính thì cá thể đó có kiểu gen dị hợp.

Ví dụ: A_ x aa → Aa : 1aa → A_ là Aa

Mục đích: Xác định kiểu gen của cá thể có kiểu hình trội

Ý nghĩa : ứng dụng để kiểm tra độ thuần chủng của giống .