- Phân bón hóa học: 
Ưu điểm: 
+ Chứa ít nguyên tố dinh dưỡng nhưng tỉ lệ chất dinh dưỡng cao.
+ Phần lớn đều dễ hòa tan trong nước (trừ phân lân) nên cây dễ hấp thụ và cho hiệu quả nhanh.
Nhược điểm:
+ Bón liên tục nhiều năm dễ làm đất hóa chua, gây hại hệ sinh vật đất, làm tồn dư phân bón hóa học trong nông sản, ảnh hưởng đến sức khỏe con người.

- Phân vi sinh:
Ưu điểm:
+ An toàn cho con người, vật nuôi, cây trồng và môi trường.
+ Bón liên tục nhiều năm không làm hại đất và có tác dụng cải tạo đất,
Nhược điểm:
+ Thời gian sử dụng ngắn.
+ Mỗi loại phân bón vi sinh chỉ thích hợp với một hoặc một nhóm cây trồng nhất định.