Tầm nhìn phát triển đến năm 2045 thì " Đông Nam Bộ trở thành vùng phát triển, có tiềm lực kinh té mạnh, cơ cấu kinh tế hiện đại; trung tâm khoa học- công nghệ và đổi mới sảng tạo, công nghiệp, công nghệ cao, logictics và trung tâm tài chính quốc tế thuộc nhóm đầu tư của khu vực và thế giới; kết cậy hạ tầng hiện đại, đồng bộ. Phát triển hài hòa giữa kinh tế với văn hóa, xã hội, bảo vệ môi trường và bảo đảm quốc phòng, an ninh; có chất lượng cuộc sống cao, có trình độ y tế giáo dục đúng đầu nhóm Đông Nam Á."

Bên cạnh những thuận lợi to lớn về kinh tế xã hội cũng như những định hướng phát triển của Đông Nam Bộ như trên thì nơi đây cũng còn tiềm ẩn nhiều khó khăn. Đôi khi những mặt thuận lợi lại luôn luôn đi kèm với những khó khăn. 

Khó khăn đầu tiên mà chúng ta có thể nhìn thấy đó là nơi đây có mật độ dân số khá cao, bên cạnh cung cấp nguồn nhân lực lơn thì việc mà người lao động từ nơi khác kéo đến nơi đây thì nó sẽ gây sức ép đối với nền kinh tế của vùng Đông Nam Bộ, theo đó cơ chế giải quyết việc làm cần được quan tâm và triển khai một cách nhanh chóng. Theo đó mật độ dân số cao thì cũng gây khó khăn cho việc giải quyết các vấn đề có liên quan đến nhà ở, y tế giáo dục... từ đó cũng chịu nhiều sức ép lớn. Tốc độ phát triển kinh tế nhanh cũng dẫn đến nguy cơ phân hóa giàu nghèo, chênh lệch mức sống khá lớn. 

Việc tập trung dân số đông như vậy còn đặt là một dấu hỏi rất lớn trong việc xử lý rác thải sinh hoạt của người dân sao cho hạn chế ô nhiễm môi trường nhất. Mật độ dân số cao, thì dĩ nhiên là lượng rác thải nơi đây sẽ lớn. Rác thải ở các khu công nghiệp và rác thải sinh hoạt nhiều thì nguy cơ ô nhiễm môi trường  cũng tăng cao. Đây là một trong những vấn đề mà cơ quan có thẩm quyền liên quan cần có những giải pháp đưa ra nhanh chóng và hiệu quả nhất có thể. 

Như vậy thì ta có thể đưa ra kết luận đó là Đông Nam Bộ là vùng có nền kinh tế khá phát triển tuy nhiên là song song với sự phát triển đó thì khu vực Đông Nam Bộ cũng còn tồn tại những khó khăn trong điều kiện tự nhiên cũng như là điều kiện kinh tế xã hội. Những thuận lợi thì sẽ luôn luôn đi kèm song song với những hạn chế.