Ô nhiễm từ nguồn nước thải khu công nghiệp, khu sản xuất
Việt Nam là một trong những quốc gia đang trong quá trình phát triển công nghiệp hóa, hiện đại hóa. Điều đó đồng nghĩa với việc các nhà máy và khu công nghiệp mọc lên ngày càng nhiều. Theo đó thì lượng nước thải từ các nhà máy xí nghiệp thải ra mỗi ngày sẽ tăng lên rất nhiều.
Ô nhiễm từ các hoạt động trong sản xuất nông nghiệp, chăn nuôi
Việt Nam là một đất nước có ngành nông nghiệp chiếm tỷ trọng cao. Các hoạt động trồng trọt, chăn nuôi gia súc, gia cầm, nuôi trồng thủy hải sản…. tại các vùng nông thôn xả ra một lượng nước thải lớn. Đa phần nước thải từ các hoạt động nông nghiệp đều không được xử lý qua bất cứ công đoạn nào mà thải trực tiếp ra môi trường. 
Ô nhiễm do lượng nước thải y tế từ các bệnh viện, phòng khám
nước thải y tế được xếp vào danh sách chất thải gây nguy hiểm. Bởi lẽ, trong rác thải y tế có chứa rất nhiều yếu tố như mầm bệnh lây nhiễm, virus, vi khuẩn nguy hiểm… Hàng ngày mỗi bệnh viện, phòng khám, các cơ sở y tế đều phải tiếp nhận, khám và chữa bệnh cho rất nhiều bệnh nhân với nhiều căn bệnh khác nhau. Vì thế mà lượng rác thải y tế vô cùng lớn.
Ô nhiễm nguồn nước ngọt, biển và đại dương do những nguyên nhân khác
Ngoài 3 nguyên nhân chính kể trên thì hiện nay, nguồn nước còn bị ô nhiễm từ các xác chết của động vật. Những xác chết động vật không được xử lý sẽ phân hủy trong tự nhiên do tác động của môi trường, dần dần ngấm sâu vào trong lòng đất, ngấm vào mạch nước ngầm. Ngoài ra những tác động từ các hiện tượng dị đoan do thời tiết gây ra cũng là một phần nguyên nhân gây ô nhiễm nguồn nước. Cùng với đó là những tác động trực tiếp của con người như việc xả rác bừa bãi ra môi trường nước.