Nếu sữa chua sau khi làm xong không được bảo quản trong ngăn mát của tủ lạnh, sẽ có nguy cơ sữa chua bị quá chua vì ở nhiệt độ phòng tạo điều kiện thuận lợi cho vi khuẩn lactic tiếp tục phát triển khiến sữa lên men. Điều này có thể dẫn đến sự thay đổi về hương vị, mùi và chất lượng của sản phẩm.