Năm 1927, Holbé qua đời để lại nhiều cổ vật có giá trị.
Hội Nghiên cứu Đông Dương đã mua lại số cổ vật ấy.
Để có chỗ gìn giữ và trưng bày số di vật của Holbé vừa mua được, cùng với nhiều cổ vật khác mà Hội đã có , Hội đã đề nghị với chính quyền xây dựng Bảo tàng.
Thuận theo đề nghị, năm 1927, thành lập Bảo tàng Blanchard de la Brosse.
Năm 1928, khánh thành Bảo tàng Blanchard de la Brosse.
Năm 1945, Bảo tàng Blanchard de la Brosse được đổi tên là Gia Định Bảo tàng viện.
Năm 1956, theo nghị định 321-GD/NĐ, đổi tên Bảo tàng là Viện bảo tàng Quốc gia Việt Nam thuộc Bộ Quốc gia Giáo dục.
Năm 1958, Viện bảo tàng Quốc gia Việt Nam chính thức mở cửa đón khách tham quan.
Năm 1975, Bảo tàng được Chính quyền Cách mạng tiếp thu nguyên vẹn.
Năm 1979, đổi tên là Bảo tàng Lịch sử Thành phố Hồ Chí Minh. Sau đổi lại là Bảo tàng Lịch sử Việt Nam - Thành phố Hồ Chí Minh và năm 2013 đổi lại tên Bảo tàng Lịch sử Thành phố Hồ Chí Minh như quyết định thành lập ban đầu.