- Đột biến gen ít gây hậu quả nghiêm trọng như đột biến NST
- Phần nhiều các đột biến gen tồn tại ở trạng thái dị hợp tử nên nếu gen đột biến lặn cũng không biểu hiện ra ngay kiểu hình.
- Qua sinh sản, sẽ tạo ra nhiều biến dị tổ hợp và gen có hại lại có thể nằm trong tổ hợp gen mới nên không gây hại hoăc trong môi trường mới gen đột biến lại không có hại.

- Đột biến gen thường là gen lặn, khi ở trạng thái dị hợp không biểu hiện kiểu hình -> không bị chọn lọc tự nhiên đào thải
- Một số tính trạng do gen đột biến quy định nhưng biểu hiện ở giai đoạn muộn, sau tuổi sinh sản -> vẫn được di truyền cho thế hệ sau
- Gen đột biến liên kết chặt với gen có lợi trong nhóm liên kết
- Gen đột biến có tác động đa hiệu, quy định nhóm tính trạng có lợi và có hại của thể đột biến