Nguyên nhân thất bại của cuộc khởi nghĩa Yên Thế bao gồm: Thiếu sự lãnh đạo của giai cấp tiên tiến với đường lối lãnh đạo đúng đắn. Tư tưởng lãnh đạo của Đề Thám (chủ hòa) không hợp với nhiều nghĩa quân (chủ chiến). ... Nghĩa quân Yên Thế chưa lấy đuợc lòng dân do đôi khi nghĩa quân vẫn cướp bóc, sách nhiễu dân chúng.