Ưu điểm lớn nhất của nước cất so với nước tự nhiên là tinh khiết, nguyên chất, không lẫn bất cứ tạp chất nào. Đặc biệt, nếu được chưng cất bằng thiết bị hiện đại, trên dây chuyền khép kín thì độ tinh khiết, nguyên chất càng cao. Khoa học đã chứng minh, khi được xử lý, điều chế và chưng cất bằng phương pháp công nghiệp, nước cất hoàn toàn loại bỏ được tạp chất vô cơ, hữu cơ, đặc biệt là các ion kim loại thường thấy trong nước thường.