Thay đổi lớn nhất trong cơ cấu kinh tế Việt Nam dưới tác động của chương trình khai thác thuộc địa lần thứ nhất của thực dân Pháp là sự chuyển dịch từ nông nghiệp sang công nghiệp. Pháp đã tập trung phát triển các ngành công nghiệp như dệt may, xi măng, gạo, đường, cà phê,... thông qua chính sách khấu trừ thuế và cho vay vốn để tiếp cận thị trường châu Âu. Điều này đã làm cho nông nghiệp trở thành một ngành mũi nhọn xuất khẩu chính của Việt Nam trong giai đoạn này. Tuy nhiên, cơ cấu kinh tế này đã phân hóa tốc độ phát triển giữa các vùng và cộng đồng, đặc biệt là sự chênh lệch về giàu nghèo giữa miền Bắc và miền Nam, tạo ra những hệ lụy cho Việt Nam sau này.