Gọi số thóc ở kho 1 ban đầu là x tấn.
Số thóc ở kho 2 ban đầu là 216 - x tấn.

Sau khi chuyển đi ở kho 1 là 12 tấn, số thóc còn lại ở kho 1 là x - 12 tấn.
Sau khi chuyển đi ở kho 2 là 15 tấn, số thóc còn lại ở kho 2 là (216 - x) - 15 tấn.

Theo đề bài, số thóc còn lại ở kho 1 bằng 3/4 số thóc còn lại ở kho 2:
(x - 12) = (3/4)((216 - x) - 15)

Giải phương trình ta có:
4(x - 12) = 3((216 - x) - 15)
4x - 48 = 3(201 - x)
4x - 48 = 603 - 3x
7x = 651
x = 93

Vậy số thóc ở kho 1 ban đầu là 93 tấn, số thóc ở kho 2 ban đầu là 216 - 93 = 123 tấn.