Nguyên nhân của hiện tượng thoái hóa là do sự giảm đa dạng gen trong quần thể, dẫn đến việc tạo ra cá thể có gen giống nhau, gây ra hiện tượng suy giảm sức kháng, suy giảm sinh sản và suy giảm sức sống.

Phương pháp tự thụ phấn bắt buộc và giao phối gần được áp dụng để tăng cường đa dạng gen trong quần thể, giúp tạo ra cá thể có gen khác nhau, từ đó cải thiện sức kháng, tăng cường sinh sản và tăng cường sức sống cho quần thể. Đồng thời, phương pháp này cũng giúp loại bỏ các gen có hại và tăng cường gen có lợi trong quần thể.