Để giải quyết bài toán này, chúng ta cần biện luận và xác định các quy luật di truyền liên quan đến các tính trạng thân cao, thân thấp, hạt bầu và hạt dài.

### 1. Biện luận và viết sơ đồ lai từ P đến F2

#### Biện luận:
- Giả sử tính trạng thân cao (A) là trội hoàn toàn so với thân thấp (a).
- Giả sử tính trạng hạt bầu (B) là trội hoàn toàn so với hạt dài (b).
- Vì hai tính trạng này là độc lập, chúng ta có thể sử dụng quy luật phân ly độc lập của Mendel.

Khi lai hai loài lúa thuần chủng:
- P: Thân cao, hạt bầu (AABB) × Thân thấp, hạt dài (aabb)

F1 sẽ có kiểu gen:
- F1: AaBb (thân cao, hạt bầu)

Khi cho F1 tự thụ phấn:
- F1 × F1: AaBb × AaBb

Sử dụng bảng Punnett để xác định các kiểu gen và kiểu hình ở F2:
- Tỉ lệ phân ly kiểu gen: 9:3:3:1
- Kiểu hình:
- Thân cao, hạt bầu: 9/16
- Thân cao, hạt dài: 3/16
- Thân thấp, hạt bầu: 3/16
- Thân thấp, hạt dài: 1/16

Theo đề bài, ở F2 có 20000 cây, trong đó có 1250 cây thân thấp, hạt bầu. Tỉ lệ này là 3/16.

#### Xác định số lượng cây trung bình của các kiểu hình còn lại ở F2:
- Tổng số cây F2: 20000 cây
- Số cây thân thấp, hạt bầu: 1250 cây (3/16)

Từ đó, ta có thể tính số lượng cây của các kiểu hình khác:
- Thân cao, hạt bầu: (9/16) * 20000 = 11250 cây
- Thân cao, hạt dài: (3/16) * 20000 = 3750 cây
- Thân thấp, hạt dài: (1/16) * 20000 = 1250 cây

### 2. Cho cây F1 lai phân tích thì tỉ lệ phân loại kiểu hình thu được của phép lai sẽ như thế nào?

Lai phân tích là lai giữa cá thể có kiểu gen chưa biết với cá thể đồng hợp lặn (aabb).

- F1 (AaBb) × aabb

Sử dụng bảng Punnett để xác định các kiểu gen và kiểu hình:
- Kiểu gen của F1: AaBb
- Kiểu gen của cá thể đồng hợp lặn: aabb

Kết quả lai phân tích sẽ cho ra các kiểu gen và kiểu hình sau:
- AaBb × aabb → AaBb, Aabb, aaBb, aabb

Tỉ lệ phân loại kiểu hình:
- Thân cao, hạt bầu (AaBb): 1/4
- Thân cao, hạt dài (Aabb): 1/4
- Thân thấp, hạt bầu (aaBb): 1/4
- Thân thấp, hạt dài (aabb): 1/4

Tỉ lệ phân loại kiểu hình thu được sẽ là 1:1:1:1.