Nước ở một số sông, hồ lại có màu đen là do: Trong các môi trường kị khí như bùn trong ao, sông, hồ,… một số vi sinh vật phân giải chất hữu cơ bắt nguồn từ xác thực vật, vận chuyển ion và electron đến chất nhận electron cuối cùng là SO42− được gọi là hô hấp sulfate. Quá trình hô hấp này tạo ra khí H₂S, khí này kết hợp với Fe có trong ao tạo ra FeS làm nước ao có màu đen.