Những hướng nghiên cứu của việc ứng dụng tế bào gốc hiện nay:

- Sử dụng tế bào gốc để tạo ra các tế bào khỏe mạnh và thực hiện chức năng chuyên hóa, các tế bào này sau đó có thể thay thế cho các tế bào bị bệnh hay giảm chức năng.

- Sử dụng các tế bào gốc trưởng thành, thai và phôi như là một nguồn tạo ra các kiểu tế bào chuyên hóa khác nhau, chẳng hạn như các tế bào thần kinh, tế bào cơ, tế bào máu và các tế bào da, sử dụng cho trị liệu các bệnh khác nhau.