Một số nguồn ô nhiễm gây rủi ro cho vùng trồng trọt là:

- Do lạm dụng thuốc bảo vệ thực vật, phân bón, kháng sinh, chất kích thích tăng trưởng, hóa chất bảo quản, chất thải chăn nuôi, giết mổ, tiêu hủy gia súc gia cầm, chất thải lầng nghề.

- Cơ sở hạ tầng yếu kém, trình độ nhận thức của nông dân còn hạn chế.

- Ô nhiễm và dịch bệnh từ nước thải và bùn thải lẫn các thức ăn dư thừa.

- Ô nhiễm khói bụi từ cháy rừng, nguy cơ xâm lấn ngập mặn, …