- Hệ thống thủy canh nước sâu thường được sử dụng khi sản xuất với quy mô nhỏ vì: Trong hệ thống thuỷ canh nước sâu, dung dịch dinh dưỡng không chuyển động khiến cho dung dịch thường xuyên bị thiếu oxygen và pH dung dịch dinh dưỡng dễ bị acid hoá gây hại cho cây trồng, nên cần được sục khí thường xuyên.

- Hệ thống thủy canh kĩ thuật màng mỏng dinh dưỡng, khí canh thường được sử dụng khi sản xuất với quy mô lớn vì: Trong 2 mô hình này, rễ cây thường xuyên được tiếp xúc với không khí nên không gặp tình trạng thiếu oxygen, đảm bảo sự sinh trưởng phát triển nhanh chóng của cây trồng. Đồng thời, 2 mô hình này cũng giúp tiết kiệm tối đa lượng dung dịch dinh dưỡng cần sử dụng.