Có thể thu được nhiều tổ hợp kiểu gene khác nhau khi cho lai giữa hai giống lúa vì:

- Trong giảm phân, hiện tượng trao đổi chéo giữa các chromatid không chị em trong cặp nhiễm sắc thể tương đồng trong kì đầu I, cùng sự phân li độc lập và tổ hợp tự do của các nhiễm sắc thể trong kì sau I đã hình thành các giao tử mang các tổ hợp gene khác nhau.

- Trong thụ tinh, sự kết hợp giữa các giao tử mang các tổ hợp gene khác nhau đã tạo nên nhiều biến dị tổ hợp ở đời con, góp phần tạo nên tính đa dạng của loài (các cá thể cùng loài một số đặc điểm sai khác).