Để tính quãng đường ôtô đã đi trong cả giai đoạn, ta sẽ tính quãng đường đi trên đoạn đường bằng phẳng và quãng đường đi lên dốc.

1. **Đoạn đường bằng phẳng (10 phút với v = 60 km/h)**:
- Thời gian đi là 10 phút, cần chuyển đổi sang giờ:
\[
10 \text{ phút} = \frac{10}{60} \text{ giờ} = \frac{1}{6} \text{ giờ}
\]
- Quãng đường đi được (s1) được tính như sau:
\[
s_1 = v \cdot t = 60 \text{ km/h} \cdot \frac{1}{6} \text{ h} = 10 \text{ km}
\]

2. **Đoạn đường lên dốc (3 phút với v = 40 km/h)**:
- Thời gian đi là 3 phút, cần chuyển đổi sang giờ:
\[
3 \text{ phút} = \frac{3}{60} \text{ giờ} = \frac{1}{20} \text{ giờ}
\]
- Quãng đường đi được (s2) được tính như sau:
\[
s_2 = v \cdot t = 40 \text{ km/h} \cdot \frac{1}{20} \text{ h} = 2 \text{ km}
\]

3. **Tổng quãng đường (s)**:
- Quãng đường ôtô đã đi tổng cộng là:
\[
s = s_1 + s_2 = 10 \text{ km} + 2 \text{ km} = 12 \text{ km}
\]

Vậy quãng đường ôtô đã đi trong cả giai đoạn là **12 km**, do đó, đáp án đúng là **A. 12 km**.