Vi khuẩn trong sữa chua hầu hết là thuộc họ Lactobacillaceae thường là vi khuẩn có dạng hình cầu hoặc hình que đứng đơn độc thành chuỗi với nhau.

- Trực khuẩn hình que, dài, xếp nối dài nhau.

- Cầu khuẩn hình trứng, xếp chồng lên nhau.