Giả sử số lần nướng bằng khay thứ nhất là x và số lần nướng bằng khay thứ hai là y.

Số bánh nướng bằng khay thứ nhất: 3x
Số bánh nướng bằng khay thứ hai: 6y

Theo đề bài, ta có hệ phương trình:
3x + 6y = 125
x + y = số lần nướng

Để tìm số bánh làm được, ta cần giải hệ phương trình này.

Nhân cả hai vế của phương trình thứ hai với 3, ta có:
3x + 3y = 3 * (số lần nướng)

Trừ phương trình này từ phương trình đầu tiên, ta có:
3x + 6y - (3x + 3y) = 125 - 3 * (số lần nướng)
3y = 125 - 3 * (số lần nướng)
y = (125 - 3 * (số lần nướng)) / 3

Để số bánh làm được là một số nguyên, số lần nướng phải chia hết cho 3 và 125 - 3 * (số lần nướng) cũng phải chia hết cho 3.

Với số lần nướng là 1, 2, 3, ..., 41, ta kiểm tra xem có số bánh làm được là một số nguyên hay không.

Ví dụ:
- Với số lần nướng là 1, ta có y = (125 - 3 * 1) / 3 = 40/3, không phải số nguyên.
- Với số lần nướng là 2, ta có y = (125 - 3 * 2) / 3 = 39/3, không phải số nguyên.
- Với số lần nướng là 3, ta có y = (125 - 3 * 3) / 3 = 38/3, không phải số nguyên.
- ...
- Với số lần nướng là 41, ta có y = (125 - 3 * 41) / 3 = 2, là số nguyên.

Vậy, số bánh làm được là 2.