Tỉnh Phú Thọ là một địa bàn có nhiều di chỉ và dấu tích của người nguyên thủy. Một số dấu tích quan trọng bao gồm:
1. Di chỉ Sơn Vi: Nằm ở xã Hát Lừu, huyện Thanh Sơn, di chỉ này có các hang động, đồ đá cũng như các công trình kiến trúc của người nguyên thủy.
2. Di chỉ Hùng Vương: Nằm ở xã Hy Cương, huyện Lâm Thao, đây là nơi được cho là nơi xây dựng đền Hùng đầu tiên và là nơi diễn ra lễ hội đền Hùng hàng năm.
3. Di chỉ Đông Sơn: Nằm ở xã Đông Sơn, huyện Thanh Thủy, đây là nơi khai quật ra nhiều đồ đồng và đồ gốm của người nguyên thủy.
4. Di chỉ Cổ Loa: Nằm ở xã Cổ Loa, huyện Đông Anh, Hà Nội (gần biên giới với Phú Thọ), đây là một di chỉ quan trọng của văn hóa Đông Sơn và là nơi có di tích của thành Cổ Loa.
Ngoài ra, còn có nhiều di chỉ khác như di chỉ Lạc Long Quân, di chỉ Hạ Mỗ, di chỉ Đồng Đậu, di chỉ Thanh Mai, di chỉ Thanh Minh... Tất cả những dấu tích này đều cho thấy sự hiện diện và ảnh hưởng của người nguyên thủy trên địa bàn tỉnh Phú Thọ.