Trong giai đoạn 1939-1945, chính sách cai trị Đông Dương của thực dân Pháp có một số điểm mới so với giai đoạn 1936-1939:

1. Chiến tranh thế giới thứ hai: Giai đoạn này diễn ra trong bối cảnh chiến tranh thế giới thứ hai, khi Pháp bị xâm chiếm bởi Đức Quốc xã và chính phủ Pháp chuyển đến Algiers. Điều này ảnh hưởng đáng kể đến chính sách cai trị Đông Dương của Pháp.

2. Sự tăng cường kiểm soát: Trong giai đoạn này, Pháp tăng cường kiểm soát và quản lý các thuộc địa Đông Dương. Họ triển khai quân đội và cảnh sát để duy trì trật tự và kiểm soát dân chúng.

3. Sự tăng cường khai thác tài nguyên: Trong bối cảnh chiến tranh, Pháp tăng cường khai thác tài nguyên của Đông Dương, như cao su, dầu mỏ và các nguyên liệu quan trọng khác, để đáp ứng nhu cầu của quân đội Pháp và các đồng minh.

4. Sự tăng cường quân sự: Pháp tăng cường quân sự ở Đông Dương để đối phó với sự tấn công của Nhật Bản và các lực lượng khác. Họ xây dựng các căn cứ quân sự và triển khai quân đội để bảo vệ lãnh thổ và quyền lợi của mình.

5. Sự tăng cường kiểm soát chính trị: Pháp tăng cường kiểm soát chính trị bằng cách thành lập các chính quyền thuộc địa và ủy thác quyền lực cho các quan chức địa phương. Điều này nhằm tạo ra sự ủng hộ và tăng cường sự ổn định trong các thuộc địa.

Tuy nhiên, điểm chung trong cả hai giai đoạn là chính sách cai trị của Pháp vẫn tập trung vào việc khai thác tài nguyên và kiểm soát dân chúng, không đáp ứng đúng mức các yêu cầu về quyền tự determination của người dân Đông Dương.