Để giải quyết bài toán này, chúng ta sẽ làm theo các bước sau:

1. **Tính lượng mật ong mỗi hũ**:
\[
\text{Lượng mật ong mỗi hũ} = \frac{36 \text{ lít}}{12 \text{ hũ}} = 3 \text{ lít/hũ}
\]

2. **Tính tổng lượng mật ong đã bán**:
\[
\text{Tổng lượng mật ong đã bán} = 3 \text{ hũ} \times 3 \text{ lít/hũ} = 9 \text{ lít}
\]

3. **Tính lượng mật ong còn lại**:
\[
\text{Lượng mật ong còn lại} = 36 \text{ lít} - 9 \text{ lít} = 27 \text{ lít}
\]

**Kết quả**: Sau khi bán 3 hũ mật ong, cửa hàng còn lại 27 lít mật ong.