Khi sử dụng phân bón hữu cơ, bạn cần lưu ý 

- Không nên sử dụng kết hợp giữa thuốc bảo vệ thực vật hoặc các chất độc hại với phân bón hữu cơ. Bởi lý do nó sẽ gây hại đến hệ vi sinh vật phát triển trong đất.

- Nếu trước khi dùng phân bón hữu cơ, bạn đã dùng quá nhiều phân hóa học và gây tích tụ tồn dư trong đất thì nên cải tạo lại đất.

- Cần tìm hiểu kỹ càng các yếu tố như nhiệt độ, loại đất hoặc cách bón phân vì nó sẽ ảnh hưởng trực tiếp đến hệ vi sinh có trong phân.

- Các quy trình sản xuất phân bón hữu cơ từ phế phụ phẩm nông nghiệp, từ vỏ giáp xác và từ phụ phẩm lò mổ đều có chung bước đầu là nguyên liệu đều lấy từ những sản phẩm, nguyên liệu thừa, giúp bảo vệ môi trường. Tùy vào loại phân hữu cơ mà thời gian ủ của chúng khác nhau