Nguyên liệu tự nhiên để hô hấp chủ yếu là ôxi (O₂). Trong quá trình hô hấp của cơ thể sống, ôxi được sử dụng để chuyển hóa năng lượng từ thức ăn, qua đó tạo ra ATP, cung cấp năng lượng cho các hoạt động sống.

Ngoài ra, carbon dioxide (CO₂) cũng là một sản phẩm phụ của quá trình hô hấp. Khi cơ thể sử dụng ôxy, nó sẽ tạo ra carbon dioxide, mà sau đó phải được thải ra khỏi cơ thể.

Tóm lại, nguyên liệu chủ yếu để hô hấp là ôxy, trong khi carbon dioxide là sản phẩm phụ của quá trình này.