* Đối với thiên nhiên:

- Vi khuẩn tham gia vào sự tuần hoàn vật chất trong tự nhiên ( phân huỷ các chất hữu cơ thành chất vô cơ cho cây sử dụng )

- Vi khuẩn góp phần hình thành than đá, dầu lửa,...
* Đối với con người:

- Trong đời sống: Vi khuẩn lên men dc ứng dụng trong muối dưa, muối cà, làm sửa chua...

- Trong công nghệ sinh học: Nhiều vi khuẩn dc ứng dụng trong công nghiệp tổng hợp protein, vitamin B12, xử lí nước thải...

- vi khuẩn có hại :

- kí sinh gây bệnh ở người và động vật 

- phân hủy làm hỏng thức ăn 

- gây ô nhiễm môi trường