Để giải quyết bài toán này, chúng ta cần xác định kiểu gen của các cây quả màu đỏ, dạng quả tròn ở thế hệ F2 đã được sử dụng để tự thụ phấn và tạo ra đời F3. Chúng ta sẽ làm điều này bằng cách phân tích các tỉ lệ kiểu hình ở đời F3.

### Bước 1: Xác định kiểu gen của cây P và F1

- Giả sử tính trạng màu quả do gen A quy định, với A (màu đỏ) trội hoàn toàn so với a (màu vàng).
- Giả sử tính trạng dạng quả do gen B quy định, với B (dạng tròn) trội hoàn toàn so với b (dạng bầu dục).

Cây P thuần chủng có kiểu hình tương phản:
- Cây quả màu đỏ, dạng quả tròn: AABB
- Cây quả màu vàng, dạng quả bầu dục: aabb

Khi lai hai cây này, F1 sẽ có kiểu gen:
- F1: AaBb (100% cây quả màu đỏ, dạng quả tròn)

### Bước 2: Xác định kiểu gen của cây F2

Cho cây F1 (AaBb) lai với cây quả màu vàng, dạng quả tròn (AaBb):
- F1: AaBb
- Cây quả màu vàng, dạng quả tròn: Aabb

Kết quả lai này sẽ tạo ra F2 với các kiểu gen và kiểu hình khác nhau.

### Bước 3: Phân tích tỉ lệ kiểu hình ở đời F3

Từ tỉ lệ kiểu hình ở đời F3:
- 39 cây quả màu đỏ, dạng quả tròn
- 9 cây quả màu đỏ, dạng quả bầu dục
- 13 cây quả màu vàng, dạng quả tròn
- 3 cây quả màu vàng, dạng quả bầu dục

Chúng ta có thể suy ra tỉ lệ phân li kiểu hình là:
- (39 + 9) cây quả màu đỏ : (13 + 3) cây quả màu vàng = 48 : 16 = 3 : 1
- (39 + 13) cây quả dạng tròn : (9 + 3) cây quả dạng bầu dục = 52 : 12 = 13 : 3

Điều này cho thấy rằng các cây quả màu đỏ, dạng quả tròn ở F2 có thể có kiểu gen dị hợp tử cho cả hai tính trạng (AaBb) hoặc dị hợp tử cho một tính trạng và đồng hợp tử cho tính trạng còn lại (AABB, AABb, AaBB).

### Bước 4: Xác định tỉ lệ kiểu gen của cây quả màu đỏ, dạng quả tròn ở F2

Dựa vào tỉ lệ kiểu hình ở đời F3, chúng ta có thể xác định rằng các cây quả màu đỏ, dạng quả tròn ở F2 có các kiểu gen sau:
- AABB
- AABb
- AaBB
- AaBb

Tỉ lệ kiểu gen của những cây này ở F2 sẽ là:
- 1 AABB : 2 AABb : 2 AaBB : 4 AaBb

### Kết luận

Tỉ lệ kiểu gen của những cây quả màu đỏ, dạng quả tròn ở F2 đã được sử dụng để tự thụ phấn là:
- 1 AABB : 2 AABb : 2 AaBB : 4 AaBb