Các cuộc đấu tranh của nhân dân ở các nước Đông Nam Á chống thực dân phương Tây từ thế kỷ XVI đến XVIII thất bại do nhiều nguyên nhân, có thể phân thành các nhóm chính dưới đây:

1. **Sức mạnh quân sự và công nghệ của thực dân**: Các quốc gia phương Tây, đặc biệt là Bồ Đào Nha, Tây Ban Nha, Hà Lan và Anh, sở hữu công nghệ quân sự tiên tiến hơn nhiều so với các quốc gia bản địa. Họ có vũ khí hiện đại, tàu thuyền lớn, cùng với chiến lược chiến tranh có tổ chức, điều này giúp họ dễ dàng đánh bại các lực lượng kháng chiến.

2. **Chia rẽ nội bộ**: Các quốc gia Đông Nam Á thường tồn tại sự chia rẽ về chính trị, tôn giáo và sắc tộc. Những mâu thuẫn nội bộ này làm yếu đi sức mạnh kháng chiến chống lại thực dân. Thay vì đoàn kết, nhiều nhóm dân cư lại tranh giành quyền lực, ảnh hưởng, và tài nguyên, dẫn đến việc đối phó với kẻ thù chung trở nên khó khăn.

3. **Thiếu sự đoàn kết và lãnh đạo**: Các phong trào kháng chiến thường thiếu sự lãnh đạo thống nhất và tầm nhìn rõ ràng. Nhiều cuộc đấu tranh bị chia rẽ và không có kế hoạch chiến lược cụ thể để đối phó với sức mạnh thực dân.

4. **Chiến lược và phương pháp đấu tranh chưa hiệu quả**: Nhiều phong trào kháng chiến áp dụng các phương pháp truyền thống và không kịp thời thay đổi chiến lược. Việc không tận dụng được những cải cách và chiến thuật hiện đại đã dẫn đến sự thất bại.

5. **Can thiệp của các cường quốc khác**: Một số cuộc kháng chiến bị can thiệp bởi các cường quốc khác, dẫn đến tình hình phức tạp hơn. Các cường quốc có thể sử dụng các phương pháp ngoại giao, liên minh hay thậm chí quân sự để ủng hộ thực dân hoặc kìm hãm phong trào kháng chiến.

6. **Chính sách cai trị và sức ép kinh tế**: Các thực dân thường áp dụng chính sách cai trị tàn bạo và gây áp lực kinh tế để dập tắt phong trào kháng chiến. Họ không chỉ chiếm giữ lãnh thổ mà còn áp đặt các quy định, thuế khóa nặng nề lên người dân, khiến họ khó có thể duy trì cuộc sống và tổ chức kháng chiến.

Những yếu tố này kết hợp lại đã khiến cho các cuộc đấu tranh của nhân dân ở Đông Nam Á chống lại thực dân phương Tây trong thời kỳ này không đạt được kết quả như mong muốn.