Theo cấu trúc (tổng hợp) :
a. Thực vật có hoa: Loại cây này có hoa, hạt giống và lá kèm theo (biểu bì ). Chúng có thể được phân thành lớp thực vật một lá mầm (monocotylid ), chẳng hạn như cỏ, tre; và lớp thực vật hai lá mầm (dicotylid), ví dụ như rau diếp, táo.
b. Không hoa: Gồm các cây có mạch máu như dương xỉ, rêu và địa y. Những loài cây này không có hoa, hạt và biểu bì.
c. Bụi cây bụi rậm: Được gọi chung là bụi cây bụi rậm, cây gỗ hay cây bụi. Bao gồm các loài cây lớn, thân gỗ mọc thẳng đứng lên trời như sồi, phong, thông…

Theo vai trò chức năng
a. Cây thực vật trồng trọt: Là các loại cây được gieo trồng nhằm phục vụ cho mục đích sản xuất nông nghiệp, thu hoạch làm lương thực, thuốc chữa bệnh, cung cấp nguyên liệu cho công nghiệp chế biến. Một số loại cây trồng phổ biến bao gồm lúa mì, ngô gạo, đậu nành, bông vải, mía đường và cà phê.
b. Cây cảnh, cây kiểng: là những cây chủ yếu dùng để trang trí, trưng bày tại nhà cửa, vườn tược, khu đô thị, công sở, các công trình công cộng khác. Có rất nhiều loại cây cảnh, từ những chậu hoa nhỏ đến cây cổ thụ to lớn và thậm chí cả những bức tường leo xanh tươi. Ví dụ bơ, sung, chanh, hoa giấy, xương rồng, sen đá vv…
c. Cây che phủ: Đây là các loại cây trồng để bảo vệ đất khỏi xói mòn, tăng độ phì nhiêu, giảm thiểu dòng chảy dinh dưỡng trong mùa khô. Phổ biến như lạc dại, kê, cỏ vetiver…, chúng thường được trồng xen kẽ với các loại cây trồng khác.
d. Loài cây rừng: Là các loài cây tự nhiên, hoang dã chưa được thuần hóa thuộc nhiều nhóm khác nhau sinh sống trong rừng, núi non, thung lũng, sa mạc. Chúng đóng vai trò thiết yếu trong việc điều hòa khí hậu, lọc nước, chống xói lở đất, ổn định bờ sông suối, lưu giữ CO2 của Trái Đất. Các ví dụ điển hình như thông đỏ, cây phong, sồi, bạch đàn, óc chó, liễu, bách xù, vân sam, thủy tùng, bách tán, vân vân.
e. Sinh vật nuôi cấy mô: Là các loài cây trồng được nuôi dưỡng và chăm sóc cẩn thận trong phòng thí nghiệm hoặc vườn ươm, có thể dùng để tạo ra các giống cây trồng mới, cải tiến quy trình canh tác hoặc bổ sung vào quần thể cây trồng ngoại lai. Ví dụ như tế bào gốc, phôi nuôi cấy mô, chồi, cành cắt cắm ghép…