Vi khuẩn có thể hình thành các loại bào tử sau:

 + Nội bào tử:

   - Thời điểm hình thành:

     * Khi vi khuẩn gặp điều kiện môi trường bất lợi: cạn dinh dưỡng, tích lũy quá nhiều độc hại,…

     * Khi đi vào giai đoạn cần nghỉ ngơi hoặc đổi mới tế bào trong chu trình sống

   - Đặc điểm bào tử: kích thước nhỏ hơn tế bào sinh dưỡng, có vỏ dày là canxi đipicôlinat, có độ chịu nhiệt cao

   - Vai trò: tăng khả năng chống chịu, không có vai trò sinh sản

 + Bào tử kín:

   - Thời điểm hình thành: giai đoạn sinh sản

   - Đặc điểm bào tử: có cuống bào tử, túi bào tử nằm trên đỉnh cuống, bên trong túi chứa các bào tử.

   - Vai trò: sinh sản

 + Bào tử trần:

   - Thời điểm hình thành: giai đoạn sinh sản

   - Đặc điểm bào tử: có cuống bào tử, đỉnh cuống phân nhánh, các bào tử đính vơi nhau trên các nhánh

   - Vai trò: sinh sản