Một số ứng dụng của enzyme trong y học và dược phẩm:

- Protease sử dụng làm thuốc tăng tiêu hóa protein, giúp cải thiện tế bào máu, có tác dụng chống đông máu, chống tăng huyết áp, tiêu mủ vết thương, làm thông đường hô hấp,…

- Amylase phối hợp với coenzyme A, cytochrome C, ATP, carboxylase để chế thuốc trị bệnh tim mạch, bệnh thần kinh, phối hợp với enzyme thủy phân để chữa bệnh thiếu enzyme tiêu hóa.

- Bromelain được dùng để giảm đau nhanh sau khi phẫu thuật, giảm đau đối với các trường hợp viêm khớp, viêm đa khớp, giảm thời gian tan các vết bầm và chống viêm.

- Trypsin và chymotrypsin được sử dụng làm thuốc tiêu viêm, làm lành vết thương, vết bỏng, làm giãn và tiêu biến niêm mạc bị hủy hoại trong một số bệnh như viêm phổi, viêm khí quản.