Dựa trên các thông tin được cung cấp, chúng ta có thể xem xét tính đúng sai của từng khẳng định:

A. **Để cai trị, thực dân phương Tây vẫn chủ trương duy trì chế độ phong kiến độc lập.**
- **Sai.** Trong hầu hết các trường hợp, thực dân phương Tây không duy trì chế độ phong kiến độc lập mà sử dụng các lãnh chúa phong kiến địa phương như một công cụ cai trị. Phong kiến địa phương vẫn tồn tại, nhưng quyền lực thực sự nằm trong tay của chính quyền thực dân.

B. **Dùng người bản xứ cai trị và đẳng cấp người bản xứ là một biện pháp xuyên suốt.**
- **Đúng.** Việc dùng người bản xứ trong quản lý thuộc địa (dưới hình thức gián tiếp) là một biện pháp phổ biến của các thực dân, nhằm tiết kiệm chi phí quản lý và đảm bảo sự ổn định.

C. **Chia để trị là hình thức cai trị nổi bật của chủ nghĩa thực dân ở Đông Nam Á.**
- **Đúng.** Chính sách "chia để trị" là một chiến lược phổ biến mà thực dân phương Tây sử dụng để làm suy yếu sức mạnh và khả năng đoàn kết của các dân tộc bản địa, từ đó dễ dàng hơn trong việc cai trị.

D. **Mâu thuẫn dân tộc trở thành mâu thuẫn chủ yếu trong xã hội Đông Nam Á khi đó.**
- **Đúng.** Mâu thuẫn dân tộc trở nên sâu sắc hơn trong thời kỳ thực dân hóa, dẫn đến sự phân chia và xung đột giữa các dân tộc khác nhau trong khu vực này.

Tóm lại:
- A: Sai
- B: Đúng
- C: Đúng
- D: Đúng