Về tôn giáo:
Nho giáo suy thoái: Do tình hình chính trị rối ren, trật tự phong kiến bị đảo lộn, Nho giáo mất đi vị thế độc tôn và ảnh hưởng sâu rộng như trước.
Phật giáo phục hồi: Phật giáo có điều kiện khôi phục lại, được nhiều chúa quan tâm cho sửa sang chùa chiền, đúc chuông, tô tượng. Tuy nhiên, Phật giáo không phát triển mạnh mẽ như thời Lý - Trần.
Đạo Thiên Chúa du nhập: Từ thế kỷ XVI, đạo Thiên Chúa bắt đầu du nhập vào Đại Việt qua các giáo sĩ phương Tây theo các thuyền buôn. Đạo Thiên Chúa dần dần được truyền bá rộng rãi trong dân chúng, nhưng sau đó cũng gặp phải sự cấm đoán từ nhà nước phong kiến.
Tín ngưỡng dân gian: Các tín ngưỡng truyền thống như thờ cúng tổ tiên, thờ thần linh, thờ Thành hoàng làng, các anh hùng hào kiệt tiếp tục được duy trì và phát triển. Đời sống tín ngưỡng của người dân ngày càng phong phú.
Về văn hóa:
Giáo dục:
Giáo dục Nho học vẫn tiếp tục phát triển nhưng có sự khác biệt giữa các vùng:
Ở Đàng Ngoài, giáo dục Nho học dần sa sút về số lượng.
Ở Đàng Trong, chúa Nguyễn cũng chú trọng đến giáo dục, khoa thi đầu tiên được tổ chức vào năm 1646.
Thời Quang Trung, chữ Nôm được đề cao và sử dụng làm chữ viết chính thống.
Văn học:
Văn học chữ Hán vẫn chiếm ưu thế.
Văn học chữ Nôm phát triển mạnh mẽ với nhiều tác phẩm nổi tiếng, thể hiện tinh thần dân tộc và đời sống xã hội đương thời.
Chữ viết:
Chữ Quốc ngữ hình thành: Trong quá trình truyền bá đạo Thiên Chúa, các giáo sĩ phương Tây đã sử dụng chữ cái Latinh để ghi âm tiếng Việt, tạo ra chữ Quốc ngữ. Loại chữ này dần dần được sử dụng phổ biến vì tính tiện lợi và khoa học.
Tóm lại:
Trong các thế kỷ XVI-XVIII, Đại Việt chứng kiến nhiều biến động về tôn giáo và văn hóa. Sự suy thoái của Nho giáo, sự phục hồi của Phật giáo, sự du nhập của đạo Thiên Chúa và sự phát triển của các tín ngưỡng dân gian đã tạo nên một bức tranh tôn giáo đa dạng. Về văn hóa, giáo dục Nho học vẫn được duy trì, văn học chữ Nôm phát triển mạnh mẽ và chữ Quốc ngữ bắt đầu hình thành. Những chuyển biến này đã góp phần làm phong phú thêm nền văn hóa Đại Việt và tạo tiền đề cho sự phát triển của văn hóa Việt Nam trong các giai đoạn lịch sử tiếp theo.